تقع بابوا غينيا الجديدة في قلب المثلث المرجاني وتسجل باستمرار بعضًا من أعلى أرقام التنوع البيولوجي البحري التي تم قياسها على الإطلاق — تستضيف منطقة خليج ميلن وحدها أكثر من 500 نوع من الشعاب المرجانية البانية للشعاب وأكثر من 1000 نوع من الأسماك. هذه واحدة من آخر الحدود العظيمة تحت الماء على الكوكب، حيث لم يتم مسح مناطق شاسعة من الشعاب المرجانية رسميًا أبدًا وقد حافظت ملكية العشائر التقليدية للشعاب المرجانية على أنظمة بيئية بأكملها لقرون.
خليج كيمبي في غرب نيو بريتن هو أحد أكثر أنظمة الشعاب المرجانية دراسة في العالم ومقر العديد من برامج الأبحاث البحرية الدولية. ترتفع مواقع مثل برادفورد شولز، وإنجليس شول، وسوزانز ريف من مياه عمقها 300 متر كقمم منعزلة. أسماك الباراكودا المتجمعة، وأسماك القرش الفضية، وأسماك القرش المطرقة العرضية شائعة، بينما تستضيف المياه الضحلة أعدادًا صحية من سلطعون الأورانجوتان، وفرس البحر القزم، وأسماك الأنابيب الشبحية.
خليج ميلن في جنوب شرق البلاد هو مسقط رأس الغوص في الطين كعلم معترف به. تستضيف الرمال البركانية السوداء في مواقع مثل شاطئ دينا ونقطة المراقبة كثافة غير عادية من الأنواع الخفية — الأخطبوط المقلد، وسمك الضفدع المشعر، وسمك الأنابيب الشبحية المزخرف، وعشرات الأنواع من العاريات الخيشومية. تقدم نفس المنطقة غوصًا عالميًا في الشعاب المرجانية في مواقع مثل شعاب تانيا والجدران الدرامية لنقطة واهو.
توفي، في شبه جزيرة كيب نيلسون، تقع بين رياس غارقة فريدة — وديان بركانية غمرتها المياه تخلق خلجانًا عميقة مع شعاب مرجانية هامشية صحية وحدائق مرجانية بكر. تقدم المنطقة بعضًا من أفضل التصوير الفوتوغرافي الماكرو في المحيط الهادئ جنبًا إلى جنب مع جدران الشعاب المرجانية التي تستضيف أسماك قرش الشعاب المرجانية، وأسماك الراي المانتا، والحياة السمكية الكثيفة. يدير منتجع توفي المحلي بالتعاون الوثيق مع القرى المجاورة.
تقدم مادانغ وبحر بسمارك شعابًا مرجانية هامشية صحية، وحطامًا من الحرب العالمية الثانية، وتركيزًا ملحوظًا من مواقع الغوص في الطين داخل الخلجان المحمية. تقع قاذفة B-25 Mitchell، وسفينة الشحن S'Jacob، والعديد من مقاتلات Zero اليابانية في أعماق قابلة للغوص، ويتم امتصاصها ببطء بواسطة الشعاب المرجانية.
لا يمكن الوصول إلى جزر ويتو وشعاب الأب في شمال بابوا إلا عن طريق سفينة غوص وتمثل بعضًا من أبعد مواقع الغوص على وجه الأرض. فتحات بركانية نشطة تحت الماء، وحقول من الهيدرويدات اللاسعة بحجم الأشجار، وتجمعات سمكية بكر تجعل هذه الرحلات الاستكشافية لا مثيل لها في المنطقة. درجات حرارة الماء التي تتراوح بين 27 و 30 درجة مئوية على مدار العام، ورؤية تتجاوز 30 مترًا في موسم الجفاف، والثراء الثقافي العميق للغات بابوا غينيا الجديدة الأصلية البالغ عددها 850 لغة يجعل هذه الوجهة فريدة حقًا.
